Szkoła Podstawowa Nr 3 im. Marynarzy Polskich w Kołobrzegu jest jednostką prowadzoną przez Gminę Miasto Kołobrzeg. Organem nadzorującym szkołę jest Zachodniopomorskie Kuratorium Oświaty w Szczecinie, oddział Koszalin.
Szkoła działa w oparciu o Ustawę o Systemie Oświaty z dnia 7 września 1991r. oraz Kartę Nauczyciela. Szkoła posiada status nadany przez Radę Miasta Kołobrzeg.